存量留抵税额是一个相对数值，以年3月31日期末留抵税额为基准数值，如果当期期末留抵税额大于或等于年3月31日期末留抵税额的基准数值，存量留抵税额为年3月31日期末留抵税额，反之，则存量留抵税额为当期期末留抵税额。
一、期末留抵税额
增值税实行链条抵扣机制，以纳税人当期销项税额抵扣进项税额后的余额为应纳税额。当进项税额大于销项税额时，即出现了留抵税额。
下图是一般纳税人增值税申报表，其中20栏“期末留抵税额”是本月底的增值税留抵税额，与我们现在探讨的“存量留抵税额”不是一个概念。
期末留抵税额=应抵扣税额合计—实际抵扣税额
可见期末留抵税额是抵扣完之后结余的留抵税额。
二、存量留抵税额
存量留抵税额不是简单的当期期末的留抵税额，而是根据增值税留抵退税制度，衍生出来的一个概念。根据《财政部税务总局关于进一步加大增值税期末留抵退税政策实施力度的公告》（年第14号）规定，一种情况是纳税人获得一次性存量留抵退税前，当期期末留抵税额大于或等于年3月31日期末留抵税额的，存量留抵税额为年3月31日期末留抵税额；当期期末留抵税额小于年3月31日期末留抵税额的，存量留抵税额为当期期末留抵税额。另外一种情况是纳税人获得一次性存量留抵退税后，存量留抵税额为零。
举例说明1：某小型企业纳税人年3月底期末留抵税额为50万元，年5月期末留抵税额40万元，则该企业年5月的存量留抵税额就是40万元。如果年6月该企业期末留抵税额变成了万元，则该企业年6月的存量留抵税额就是50万元。从这个例子中我们可以看出，留抵税额是以年3月底数值为基数，期末留抵税额与之对比，如果期末留抵税额低于基数值，则留抵税额就为当期期末留抵税额，如果期末留抵税额大于基数值，则留抵税额就为年3月底的留抵税额。
举例说明2：承接上个例子，某小型企业纳税人年3月底期末留抵税额为50万元，如果年6月该企业期末留抵税额变成了万元，并于当月申请退还增量留抵税额，如果该企业年6月申请一次退还增量留抵税额为万元，则下个月7月的存量留抵税额就是0万元。
三、可以申请存量留抵税额的企业
1.前提条件：企业的纳税信用等级为A级或者B级；申请退税前36个月未发生骗取留抵退税、骗取出口退税或虚开增值税专用发票情形；申请退税前36个月未因偷税被税务机关处罚两次及以上；年4月1日起未享受即征即退、先征后返（退）政策。
2.按照企业规模划分。微型企业，小型企业，可以分别自年4月、5月纳税申报期起向主管税务机关申请一次性退还存量留抵税额。
3.按照行业划分。“制造业”、“科学研究和技术服务业”、“电力、热力、燃气及水生产和供应业”、“软件和信息技术服务业”、“生态保护和环境治理业”和“交通运输、仓储和邮政业”等行业。这些行业的中型企业，大型企业，可以分别子年7月、10月纳税申报期起向主管税务机关申请一次性退还存量留抵税额。
四、存量留抵退税政策情况
存量留底退税政策执行期限为年12月31日，新的年，存量留抵退税政策能否延续，尚未出台相关政策。